新工具能显著降低基因编辑脱靶效应

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新工具能显著降低基因编辑脱靶效应

科技日报北京 5 月 19 日电（记者瞿剑）记者 19 日从中国农科院获悉，该院深圳农业基因组研究所左二伟研究组联合中科院脑科学与智能技术卓越创新中心、中科院上海营养与健康研究所，根据蛋白结构预测了基因编辑过程中产生脱靶效应的重要氨基酸，并在不影响催化活性的情况下突变相应的氨基酸，最终得到了显著降低基因编辑脱靶效应的单碱基编辑工具。相关研究成果日前在线发表于《自然 · 方法学》（Nature Methods）杂志。

左二伟介绍，CRISPR/Cas9 的衍生工具单碱基编辑技术，可以在不切断 DNA 双链的情况下实现单核苷酸的定向突变，为治疗单碱基突变引起的遗传性疾病带来了希望。但 2019 年以来，其安全性受到了质疑。据认为，单碱基编辑器会导致严重的 DNA 和 RNA 脱靶效应，临床应用存在安全风险。此前，国内外多位科学家通过多种方式研究降低基因编辑 DNA 和 RNA 脱靶效应的方法，取得了一定进展，但也存在局限性。

左二伟团队此次基于 GOTI 的方法是不受限制的，不仅可以检测单碱基编辑工具，还可以用来对其他基于 ZFN、TALEN 和 CRISPR/Cas 的基因编辑工具进行安全性检测和改进。团队使用 GOTI 和 RNA-Seq 同时检测了突变体的 DNA 脱靶和 RNA 脱靶，并且发现 DNA 和 RNA 的脱靶是互相独立的，需要同时检测。研究获得的 YE1-BE3-FNLS 是高精度、高活性单碱基编辑工具，显著降低了脱靶效应并提高了编辑效率，有望应用于遗传疾病基因治疗，推动基因编辑临床化应用。

源井生物是海外归国人员和生物科技领域行业精英联合创建的高科技企业，坐落于广州高新技术产业的示范基地——科学城。源井生物拥有1000平方的实验室和办公区域，包含基因编辑技术平台，细胞生物学技术平台和斑马鱼研究技术平台。源井生物是以提供基因编辑载体/病毒/细胞，原代细胞和斑马鱼相关产品及服务的高科技企业，旨在为客户提供更好的细胞或动物水平研究的基因编辑工具。

让基因编辑更简单，是源井生物的企业目标。CRISPR-U™是源井生物自主研发的基因编辑技术（基于CRISPR / Cas9技术），CRISPR-U™技术比普通CRISPR/Cas9技术的基因切割效率更高，同时可以大幅度提升同源重组效率，轻松实现细胞和动物水平的基因敲除（KO）、基因点突变（PM）和基因敲入（KI）。利用CRISPR-U™的技术优势，源井生物已成功在超过70种细胞系上实现基因编辑。

CRISPR-B™是源井生物在基于Red/ET重组系统和CRISPR/Cas9基因编辑系统基础上，通过自主研发优化基因编辑载体和基因编辑流程，在基因编辑效率和准确性均远高于传统方法的一项创新性技术。该技术可以广泛应用于细菌和真菌的基因编辑，轻松实现细胞和动物水平的基因敲除（KO）、基因点突变（PM）和基因敲入（KI）。源井生物拥有超过400种的原代细胞产品，包括人、大鼠和小鼠等不同物种、不同组织来源的上皮细胞，内皮细胞，平滑肌细胞和成纤维细胞等，同时针对每种细胞均可以提供严格的质量鉴定报告，产品已广泛应用到知名科研院所和制药企业。

一、基因编辑技术平台
——聚焦于CRISPR-U™和CRISPR-B™基因编辑技术的应用
1、平台可提供各类型的基因编辑载体，应用于不同生物的基因编辑；
2、平台可提供多类型的病毒包装，包括慢病毒，腺病毒和腺相关病毒等相关服务；
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