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KnockTF数据库是一个全面的人类转录因子敲降/敲除的基因表达谱数据库。转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱分析是获得转录因子靶基因、探索转录因子功能的最重要策略之一。
哈尔滨医科大学大庆校区医学信息学系李春权教授的生物信息课题组在转录因子领域取得重大成果,研究论文《KnockTF:a comprehensive human gene expression profile database with knockdown/knockout of transcription factors》于2019年10月被Nar杂志(Nucleic Acids Research,SCI影响因子11.147)接收并已发表,张建老师作为共同通讯作者,冯陈晨老师为第一作者。
KnockTF数据库是一个全面的人类转录因子敲降/敲除的基因表达谱数据库。转录因子(Transcription Factor, TF)及其靶基因在人类疾病和生物学过程中起重要作用,转录因子敲降/敲除前后的基因表达谱分析是获得转录因子靶基因、探索转录因子功能的最重要策略之一。
KnockTF提供了大量与转录因子敲降/敲除相关的人类基因表达谱数据集、转录因子及其靶基因的注释信息、转录因子的上游通路信息和下游靶基因的功能注释信息,以及转录因子绑定到靶基因启动子、增强子和超级增强子的详细绑定信息。
KnockTF数据库构建了一个转录因子——差异表达基因网络,方便用户进行网络分析可视化,帮助阐明了转录因子相关的功能和潜在的生物学效应。上线一个月内,数据库网站点击率已达到1300余次,在转录因子的研究领域正在发挥着良好的作用,为生命科学领域提供了强大的转录因子及增强子生物信息资源和分析策略。
该研究得到了国家自然科学基金、黑龙江省自然科学基金、博士后基金、校内伍连德基金以及校内科研创新基金等项目的资助。
源井生物是海外归国人员和生物科技领域行业精英联合创建的高科技企业,坐落于广州高新技术产业的示范基地——科学城。源井生物拥有1000平方的实验室和办公区域,包含基因编辑技术平台,细胞生物学技术平台和斑马鱼研究技术平台。源井生物是以提供基因编辑载体/病毒/细胞,原代细胞和斑马鱼相关产品及服务的高科技企业,旨在为客户提供更好的细胞或动物水平研究的基因编辑工具。
让基因编辑更简单,是源井生物的企业目标。CRISPR-U™是源井生物自主研发的基因编辑技术(基于CRISPR /
Cas9技术),CRISPR-U™技术比普通CRISPR/Cas9技术的基因切割效率更高,同时可以大幅度提升同源重组效率,轻松实现细胞和动物水平的基因敲除(KO)、基因点突变(PM)和基因敲入(KI)。利用CRISPR-U™的技术优势,源井生物已成功在超过70种细胞系上实现基因编辑。
源井生物拥有超过400种的原代细胞产品,包括人、大鼠和小鼠等不同物种、不同组织来源的上皮细胞,内皮细胞,平滑肌细胞和成纤维细胞等,同时针对每种细胞均可以提供严格的质量鉴定报告,产品已广泛应用到知名科研院所和制药企业。
一、基因编辑技术平台
——聚焦于CRISPR-U™基因编辑技术的应用
1、平台可提供各类型的基因编辑载体,应用于不同生物的基因编辑;
2、平台可提供多类型的病毒包装,包括慢病毒,腺病毒和腺相关病毒等相关服务;
3、平台可提供高质量的基因敲除,基因点突变和基因敲入稳转细胞株技术服务。
二、细胞生物学技术平台
——聚焦于原代细胞的科研工具供应商
1、平台可提供超过400种原代细胞研用细胞库;
2、平台可提供不同细胞类型所需要的培养方案和相关培养产品;
3、平台可提供细胞分离,提取,鉴定等常规细胞生物学技术服务。
务实,高效,坦诚和守信是源井生物的企业准则,我们立志于服务好每一位选择源井,信任源井的客户,为客户提供有价值的产品和服务而不懈努力。