年度总结 | 2025 源井生物高分引用文献合集

1.题目： Ninjurin-1 mediates cell lysis and detrimental inflammation of PANoptosis during influenza A virus infection

期刊： Signal Transduction and Targeted Therapy

影响因子： 52.7

引用产品/服务： NINJ1 Knockout cell line (A549) 、 NINJ1 Knockout cell line (THP-1) 敲除细胞系

文章摘要： 甲型流感病毒（IAV）诱导ZBP1介导的泛凋亡（PANoptosis），这是一种溶解性炎症细胞死亡形式，其特征在于凋亡、坏死性凋亡和焦死通路的同步激活。Ninjurin-1（NINJ1）是近期发现的细胞膜破裂介导因子，但在不同类型细胞死亡中发挥多样化功能。然而，NINJ1在IAV诱导的泛凋亡及病毒性肺炎中的作用尚不明确。本研究发现IAV感染可诱导NINJ1表达上调，其随后发生寡聚化并在感染巨噬细胞中介导细胞溶解。NINJ1缺失可阻断质膜破裂及危险相关分子模式（DAMPs）和白细胞介素-1β（IL-1β）的释放，但不影响细胞死亡进程。任何单一泛死亡通路的激活均足以诱导NINJ1寡聚化及强效细胞裂解。相应地，仅当所有泛死亡通路同时受阻时，才能阻止NINJ1寡聚化、细胞死亡及细胞破裂。体内NINJ1敲除亦可减轻IAV诱导的肺损伤及死亡率。此外，我们发现NINJ1上调与COVID-19患者预后不良存在关联。综合而言，本研究揭示NINJ1在IAV感染免疫病理中的关键作用，并提示其可作为病毒性肺炎及病毒性脓毒症疾病严重程度和预后评估的生物标志物。

图1. 文章部分结果图

2.题目： Peptide Amphiphiles Hitchhike on Endogenous Biomolecules for Enhanced Cancer Imaging and Therapy

期刊： Advanced Materials

影响因子： 26.8

引用产品/服务： LDL-R Knockout cell line (Hela) 敲除细胞系

文章摘要： 纳米材料与体内生物分子的相互作用决定了其生物学命运。本研究表明，自组装肽两亲分子（PA）纳米结构可与内源性生物分子动态交互，并利用天然生理过程靶向多种实体瘤。在循环系统中，自组装PA纳米结构主要与脂蛋白解聚重组，从而延长血液循环时间，显著提升肿瘤部位的药物聚集与滞留效率。机制研究表明，PA通过与癌细胞膜组装实现内化，且该过程独立于特异性受体。基于此相互作用，本研究开发的PA（即自组装-谷氨酸，SA-E）在多种异种移植、同源移植、患者来源异种移植及转基因啮齿动物模型中均展现出特异性富集。此外，SA-E能将高效化疗药物精准递送至不同同源移植和异种移植肿瘤，同时显著降低副作用。凭借其简洁的模块化设计和普适性肿瘤聚集机制，SA-E有望成为癌症成像与治疗领域具有广阔前景的平台。

图2. 研究机制图

3.题目： Structural insight into GPR155-mediated cholesterol sensing and signal transduction

期刊： Science Bulletin

影响因子： 21.1

引用产品/服务： GPR155 Knockout cell line (HEK293) 敲除细胞系

文章摘要： 胆固醇（CHL）是膜生物合成的基本构建块，也是氧化胆固醇、类固醇激素、胆汁酸和维生素D的前体物质。溶酶体是低密度脂蛋白（LDL）的主要分拣站，LDL负责运输膳食胆固醇，同时也是细胞内生长调控核心——机械靶向雷帕霉素复合物1（mTORC1）蛋白激酶的激活位点。最近有报道称，溶酶体跨膜蛋白GPR155通过将GTP酶激活蛋白隔离到Rags 1（GATOR1）处，向mTORC1传递胆固醇充足的信号。尽管近期报道的GPR155结构已揭示其胆固醇结合位点，但信号如何从该位点传递至GPR155可溶性部分及GATOR1仍属未知。通过获得三种不同构象下GPR155与CHL复合物的冷冻电镜结构，并辅以长期分子动力学模拟，我们观察到不同结构域的动态重排。CHL结合导致转运蛋白域与GPCR域间的裂隙扩大。在其他结构中未被解析的跨膜螺旋16（TM16）前延伸螺旋，作为连接杠杆，在CHL结合时将GPCR域的旋转传递至GPR155的可溶性部分。这项工作不仅解答了GPR155如何感知CHL的问题，更揭示了更深层的机制：跨膜区感知到的信号如何传递至LED和DEP。

图3. 文章部分结果图

1.题目： A donor PD-1+CD8+ TSCM-like regulatory subset mobilized by G-CSF alleviates recipient acute graft-versus-host-disease

期刊： Signal Transduction and Targeted Therapy volume

影响因子： 52.7

引用产品/服务： hBCL6 CRISPR/Cas9 knockout lentiviral vector

文章摘要： 供者选择决定了异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）后急性移植物抗宿主病（aGVHD）的发生。为优化现有临床供者筛选标准并识别与受者预后改善相关的潜在供者淋巴细胞亚群，我们分析了80例粒细胞集落刺激因子（G-CSF）动员供者外周血中的CD4+和CD8+亚群，并评估了对应80例半相合及全相合异基因造血干细胞移植受者的aGVHD发生率。不同供者间G-CSF诱导的亚群扩增存在差异。我们发现合格供者中存在一种新型PD-1+CD8+CD45RA+CCR7+ T淋巴细胞亚群，其与急性移植物抗宿主病发生率降低及移植后抗感染能力显著相关。该亚群的抗移植物抗宿主病活性在验证队列（n=30）中得到证实。单细胞RNA测序揭示该T细胞亚群具有干细胞样记忆T细胞（TSCM）的转录组特征，兼具调节性T细胞（Treg）和效应T细胞（Teff）双重活性，表明其在抑制急性移植物抗宿主病与发挥移植物抗白血病效应（GVL）方面具有双重功能。 有趣的是，经粒细胞集落刺激因子动员后，供体PD-1+CD8+ TSCM样调节细胞以BCL6依赖性方式增强了PD-1表达。随后我们发现该亚群的小鼠对应物（PD-1+CD8+CD44-CD62L+）可缓解急性移植物抗宿主病（aGVHD），并证实该亚群存在于临床受者体内。综上所述，我们首次鉴定出一种新型供体外周T细胞亚群，该亚群在抑制急性移植物抗宿主病的同时促进受者免疫重建。该亚群可作为选择最佳半相合及完全相合供体的指标。值得注意的是，这些T细胞兼具调节性T细胞（Treg）和效应T细胞（Teff）的双重功能，使其不仅成为治疗急性移植物抗宿主病的潜在手段，更可用于治疗自身免疫性疾病。

图4. 文章部分结果图

2.题目： Emerging of Ultrafine Membraneless Organelles as the Missing Piece of Nanostress: Mechanism of Biogenesis and Implications at Multilevels

期刊： ACS Nano

影响因子： 16

引用产品/服务： The lentivirus (CMV promoter) carrying CRISPR/Cas9 System, G3BP1-sgRNA, G3BP2-sgRNA, and G3BP1-fused with BFP/EGFP was all purchased from Ubigene technology and used as received

文章摘要： 理解纳米材料与细胞结构之间的相互作用，对纳米粒子在生物医学中的应用至关重要。我们发现了一种由金纳米棒（AuNRs）诱导形成的应激颗粒亚型，称为纳米材料诱导应激颗粒（NSGs）。这类NSGs在物理特性和生物功能上均与传统应激颗粒存在差异。AuNRs的摄入导致细胞内活性氧积累和蛋白质错误折叠，进而形成NSG。物理结构上，NSG具有凝胶状核心和液态外壳，其特性受热休克蛋白70（HSP70）正向调控，而热休克蛋白90（HSP90）及泛素-蛋白酶体系统则对其产生负向调控。AuNRs通过与G3BP1相互作用促进NSG组装，降低液-液相分离所需能量。NSG通过影响mRNA监测机制及激活腺苷酸活化蛋白激酶信号通路（该通路对细胞应激反应至关重要）来调控细胞功能。本研究揭示了LLPS在纳米材料代谢中的关键作用，并提出纳米液滴可作为药物递送策略的潜在靶点，推动纳米医学领域发展。

图5. 研究机制图

题目： Knockout of the sulfide: quinone oxidoreductase SQR reduces growth of HCT116 tumor xenograft

期刊： Redox Biology

影响因子： 11.9

引用产品/服务： YKO-RP006-hRABL6 [gRNA] plasmids

文章摘要： 结直肠癌（CRC）具有显著的多样性和异质性，亟需开发新型治疗靶点。多硫化物与CRC进展及免疫逃逸相关，但其潜在机制尚未完全阐明。硫化物：醌氧化还原酶（SQR）作为线粒体黄素蛋白，可催化硫化氢（H₂S）氧化及多硫化物生成。本研究深入探究了SQR在CRC发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力。研究发现，SQR敲除会破坏HCT116 CRC细胞中的多硫化物稳态，削弱线粒体功能，抑制细胞增殖并诱导早期凋亡。此外，SQR敲除显著缩小了结肠异种移植小鼠模型的肿瘤体积。尽管糖酵解基因转录基本未变，代谢组学分析显示果糖-1,6-二磷酸降解环节（由丙酮酸激酶A催化）发生重编程。Western blot分析与酶活性检测均证实ALDOA水平及活性下降。综上所述，本研究确立了SQR在结直肠癌线粒体功能及代谢调控中的关键作用，其敲除可导致代谢重编程并抑制HCT116肿瘤异种移植模型的生长。这些发现为开发针对SQR的结直肠癌靶向治疗奠定了基础。

图6. 文章部分结果图

题目： Colorectal Cancer Cells–Derived Exosomal PIK3CA Mutation DNA Promotes Tumor Metastasis by Activating Fibroblast and Affecting Tumor Metastatic Microenvironment

期刊： Advanced Science

影响因子： 14.1

引用产品/服务： 对携带 PIK3CA H1047R突变的 LS174T 细胞进行基因编辑

文章摘要： 外泌体通过传递肿瘤特异性物质参与肿瘤转移微环境（TME）的形成。然而，现有研究主要聚焦于外泌体RNA和蛋白质，对外泌体DNA的深入探索尚显不足。研究发现，结直肠癌（CRC）细胞来源的外泌体中携带的PIK3CAH1047R突变DNA可转运至受体成纤维细胞，经转录与翻译后，通过与磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）通路内源性P85调节亚基的相互作用，最终促使成纤维细胞转化为癌相关成纤维细胞（CAFs）。(PI3K)通路的内源性P85调节亚基。CAFs通过分泌高水平IL6促进肿瘤细胞体外迁移，并在体内加速肺转移。此外，在原发灶和转移灶的CAFs中均检测到PIK3CAH1047R突变，表明该突变可能通过影响肿瘤微环境促进转移。此外，携带PIK3CAH1047R突变且IL6水平升高的结直肠癌患者发生转移的风险显著增加。这些发现表明，同时检测血清来源的外泌体PIK3CAH1047R突变与血清IL6分泌水平，可作为结直肠癌有前景的诊断和预后工具；而同时靶向PIK3CAH1047R突变与IL6，则可能成为治疗结直肠癌的新途径。

图7. 研究机制图

题目： GPNMB disrupts SNARE complex assembly to maintain bacterial proliferation within macrophages

期刊： Cellular & Molecular Immunology

影响因子： 19.8

引用产品/服务： THP-1细胞

文章摘要： 吞噬作用在抑制巨噬细胞内细菌生长方面发挥着关键作用。然而，细菌感染过程中调控自噬体-溶酶体融合的机制尚未完全阐明。在此，我们利用麻风病这一理想模型，探索宿主防御机制与细菌感染之间的相互作用。我们重点研究了糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B（GPNMB），该蛋白在瘤型麻风（L-Lep）患者巨噬细胞中高度表达，并在细菌感染期间干扰异物吞噬作用。感染过程中，GPNMB与定位于自噬体的STX17相互作用，导致GPNMB N296位点的N-糖基化水平降低。该修饰促进SNAP29降解，从而阻断STX17-SNAP29-VAMP8 SNARE复合体的组装。由此导致自噬体与溶酶体的融合受阻，抑制细胞自噬流。除麻风分枝杆菌外，GPNMB缺陷还阻碍多种细胞内细菌在人巨噬细胞中的增殖，表明GPNMB在细胞内细菌感染中具有普遍作用。此外，与对照组相比，Gpnmbfl/fl Lyz2-Cre小鼠体内海分枝杆菌扩增量显著降低。总体而言，本研究揭示了GPNMB在宿主抗菌防御中未被认识的作用，并深入阐释了其在SNARE复合体组装中的调控机制。

图8. 研究机制图

题目： Engineering nanozyme immunomodulator with magnetic targeting effect for cascade-enzyodynamic and ultrasound-reinforced metallo-immunotherapy in prostate carcinoma

期刊： Nature Communications

影响因子： 15.7

引用产品/服务： Luc-RM-1 cell line

文章摘要： 传统免疫疗法因肿瘤微环境（TME）的免疫抑制特性而表现出较低的响应率。为克服这一局限，本研究引入具有ZnFe₂O₄@Pt核心和葡萄糖氧化酶（GOx）外壳的ZFPG纳米颗粒（ZFPG NPs）。该纳米粒子兼具五种酶活性、优异声敏特性及卓越磁靶向能力，可实现雄性小鼠前列腺癌的声-金属-免疫联合治疗。其磁靶向能力显著提升肿瘤部位药物富集效率，同时保持对肝肾组织的富集特性。该纳米颗粒的多酶级联催化与声敏特性可高效耗竭谷胱甘肽和葡萄糖，增强过氧化氢的生成与利用，从而诱导多轮活性氧爆发。此外，这些综合效应通过上调血红素氧化酶1（HMOX1）促进Fe²⁺与脂质过氧化物积累，进而诱导免疫原性铁死亡。该策略通过改善免疫抑制性肿瘤微环境并抑制肺转移进展，有效增强抗肿瘤免疫力。这种协同作战策略为突破传统免疫疗法局限提供了强有力的解决方案。

图9. 研究机制图

题目： Hyperacute rejection-engineered oncolytic virus for interventional clinical trial in refractory cancer patients

期刊： Cell

影响因子： 42.5

引用产品/服务： EZ-Stem™ 干细胞培养基

文章摘要： 近年来，溶瘤病毒（OV）疗法在恶性肿瘤治疗中展现出巨大潜力。然而，静脉注射的安全性问题及固有的免疫缺陷是临床应用中的两大限制因素。本研究成功开发出携带猪α1,3-谷氨酰转移酶基因的重组新城疫病毒（NDV-GT），该病毒可诱导超急性排斥反应。在临床前研究中，我们验证了该疗法的可行性。通过创新性CRISPR介导的原发性肝细胞癌猴模型实验表明，静脉注射的NDV-GT对肿瘤细胞具有卓越的清除能力。值得注意的是，针对20例复发/难治性转移性癌症患者开展的干预性临床试验 （WHO中国临床试验注册号：ChiCTR2000031980）显示：疾病控制率达90.00%，疗效持久，且未出现严重不良事件及临床功能性中和抗体，进一步证实该病毒在该条件下免疫原性极低，验证了NDV-GT用于免疫病毒疗法的可行性。综上所述，我们的研究结果证明了静脉注射NDV-GT的高安全性和高效性，为肿瘤治疗及其他领域的病毒载体疗法提供了创新技术。

图10. 文章摘要图解

题目： Intelligent Nano‐Cage for Precision Delivery of CRISPR‐Cas9 and ACC Inhibitors to Enhance Antitumor Cascade Therapy Through Lipid Metabolism Disruption

期刊： Advanced Functional Materials

影响因子： 19

引用产品/服务： Cas9-EGFP fusion protein

文章摘要： 脂质代谢重编程是癌症的标志性特征，而靶向脂肪酸合成中的关键酶——乙酰辅酶A羧化酶1（ACC1），则成为极具前景的治疗策略。本文构建了肽修饰红细胞膜纳米笼（NTA630-NCs-RBCM-T），用于递送CRISPR-Cas9和ACC1抑制剂，实现对ACC1的双重抑制，从而优化抗肿瘤级联疗法的有效性。NTA630-NCs-RBCM-T通过肽介导靶向高效递送至癌细胞，在溶酶体酶、质子海绵效应及谷胱甘肽水平升高的作用下释放Cas9复合物和ND630。通过Cas9介导的泛素特异性蛋白酶22（USP22）敲除及ND630的直接抑制，同步阻断脂肪酸合成通路，增强多不饱和脂肪酸（PUFAs）摄取，诱发脂质过氧化反应，最终导致肿瘤细胞死亡——特别是铁死亡与凋亡，从而实现高效抗肿瘤活性。

图11. 文章部分结果图

题目： Auricular malformations are driven by copy numbervariations in a hierarchical enhancer cluster and a dominant enhancer recapitulates human pathogenesis

期刊： Nature Communications

影响因子： 15.7

引用产品/服务： EZ-editor™单克隆基因型鉴定试剂盒

文章摘要： 增强子通过转录因子（TFs）的组合作用，决定了基因表达的空间特异性和表达水平，其异常可导致疾病。虽然HMX1下游增强子与耳部畸形相关，但双侧耳廓狭窄（BCE）的发病机制仍不清楚。本研究发现一个包含三个增强子的拷贝数变异（CNV）——统称为定位身份分层增强子簇（PI-HEC）——通过协调调控HMX1表达驱动BCE发生。每个增强子均展现独特的活性-定位-结构特征，其中主导增强子通过高移动性组（HMG）盒结合协调因子与同源域转录因子基序，分别调控其活性与特异性。小鼠模型证实：耳廓基部异常表达Hmx1的神经嵴来源成纤维细胞，伴随耳廓远端异位表达，会破坏外耳发育，影响软骨、肌肉及表皮发育。本研究阐明了哺乳动物耳部形态发生机制，并揭示了增强子内部及增强子与转录因子之间协同调控的复杂性。

图12. 研究机制图