CRISPR文库体内筛选_文库分析平台_源井生物

CRISPR-iScreen™体内筛选

还原真实生物环境，助力科研转化突破

为什么选择CRISPR文库体内筛选？

在基础研究与药物开发中，体外筛选凭借高通量与灵活性，常用于早期靶点发现与机制探索。但若要深入研究 免疫互作、耐药机制、肿瘤转移、系统性效应 等复杂问题，仅凭体外体系是不够的。 体内筛选 能够在完整生物体中模拟真实环境，揭示基因功能在复杂微环境与动态系统中的真实作用，是科研走向临床不可或缺的环节。

源井技术优势

选择源井，意味着选择更高效、更精准的体内筛选方案

全流程精细化服务

源井生物具备完善的预实验摸索和质量管理体系，能够提供全流程CRISPR文库体内筛选一站式服务，轻松衔接各个流程节点。

全流程优化的CellPool制备工艺

全流程优化的CellPool制备工艺,实现文库Cell Pool规模化和标准化生产，做到批间差异小、重复性好，现有400+ Screening-ready Cell Pool覆盖度高达99%。

iScreenAnlys™文库分析平台

免费解锁智能分析，零代码操作，上传测序数据，自动完成质控、MAGeCK 统计、通路富集。直接生成靶点排名热图、差异基因火山图，可直接用于论文初稿。

丰富经验

依托在肿瘤、免疫和耐药等模型中的丰富筛选经验，能够灵活应对不同研究场景，确保结果的可靠性与可转化性。

CRISPR文库体内筛选技术路线

文库细胞构建

小鼠成瘤预实验

文库细胞成瘤（肿瘤药物处理）

肿瘤组织取材

NGS测序分析

技术服务详情

文库细胞体内成瘤

文库细胞进行皮下接种，成瘤后取肿瘤组织进行NGS测序分析

实验周期： 8-12周

交付内容： NGS测序分析报告以及小鼠成瘤相关实验数据

文库细胞成瘤药筛

文库细胞进行皮下/原位接种，成瘤后，将小鼠进行随机分组；肿瘤经药物处理后，收取各组肿瘤组织进行NGS测序分析

实验周期： 8-16周

交付内容： NGS测序分析报告以及小鼠成瘤药筛相关实验数据

文库细胞肿瘤转移

文库细胞经原位接种或尾静脉注射后，肿瘤细胞定植于其他器官；收取定植于其他组织的肿瘤细胞和原位肿瘤组织进行NGS测序分析

实验周期： 12-20周

交付内容： NGS测序分析报告以及小鼠肿瘤转移相关实验数据

CRISPR文库体内筛选成功案例展示

小鼠肿瘤组织取材

小鼠肿瘤变化

生信分析结果Rank view 负筛

生信分析结果sgRNA Rank view

应用案例

Genome-wide CRISPR screen in a mouse model of tumor growth and metastasis

IF=42.5

Cell

Genome-wide CRISPR screen in a mouse model of tumor growth and metastasis

摘要：
在本研究中，作者采用CRISPR-Cas9介导的全基因组敲除筛选系统，探究肿瘤生长与转移的遗传学基础。作者使用包含67,405条sgRNA的全基因组文库，对非转移性小鼠癌细胞系进行大规模体内功能筛选，将构建好的cell pool移植至免疫缺陷小鼠体内后，可快速诱发转移灶形成。通过评估肺转移灶和晚期原发肿瘤中富集的sgRNA及其相关性分析，表明特定功能的缺失突变驱动了肿瘤生长和转移进程。单独对显著sgRNA进行验证，或采用包含初筛高分基因的624条sgRNA亚库进行筛选，均能显著加速转移进程。该研究也证实了，CRISPR体内筛选可以作为一种十分有效的手段，用于系统性解析癌症体内进化过程中的基因表型。查看详情>>

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In vivo CRISPR screens identify the E3 ligase Cop1 as a modulator of macrophage infiltration and cancer immunotherapy target

IF=42.5

Cell

In vivo CRISPR screens identify the E3 ligase Cop1 as a modulator of macrophage infiltration and cancer immunotherapy target

摘要：
尽管免疫检查点阻断（ICB）在癌症治疗中表现出显著的临床疗效，但其对三阴性乳腺癌（TNBC）的治疗效果仍有限。在这项研究中，作者通过进行小鼠体内的CRISPR筛选寻找出可以调控三阴性乳腺癌免疫治疗效果的重要蛋白E3泛素化连接酶Cop1，并进一步阐述其调控乳腺癌生长进展的细胞内及细胞外机制。作者首先构建了靶向约4500个小鼠基因的CRISPR/Cas9筛选文库，并使用该文库感染小鼠三阴性乳腺癌细胞系4T1细胞。原位注射后，在16天后收集小鼠4T1三阴性乳腺癌组织，逐个提取肿瘤组织进行NGS测序，并通过生信分析筛选出一系列可调控三阴性乳腺癌细胞免疫治疗应答的潜在候选基因。为了进一步增加小鼠在体CRISPR/Cas9筛选的可靠性，作者在候选基因中挑选出约80个基因，并以此构建第二轮筛选文库，通过新一轮的筛选，最终揭示出E3泛素化连接酶Cop1是调控三阴性乳腺癌治疗的关键靶点。查看详情>>