构建基因敲除细胞株全攻略 | 掌握关键步骤,助力科研高分发表

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构建基因敲除细胞株全攻略 | 掌握关键步骤,助力科研高分发表

发布日期:2025年06月03日
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构建基因敲除细胞株全攻略 | 掌握关键步骤,助力科研高分发表

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随着CRISPR/Cas9基因编辑技术的快速发展,科学家们在研究基因功能、验证药物靶点、探究分子机制等方面迎来了前所未有的变革。特别是通过构建 基因敲除(Knockout, KO)细胞株, 可以实现目标基因的永久性失活,成为功能研究中不可或缺的重要工具。

然而,从理论到实践,构建一个高质量的KO细胞株并非易事。每一个实验环节都需要严谨设计、精准操作与丰富的经验支持。本文将为您系统梳理基因敲除细胞株的标准构建流程,并结合源井生物的CRISPR-U™平台,助您高效、高成功率地完成敲除细胞系构建。

标准工作流程:构建敲除细胞株的五大步骤

· 设计基因敲除方案,构建gRNA表达载体

· 细胞转染

· 初步筛选并扩增KO细胞群体

· 单克隆细胞挑选与扩增

· KO效果验证(基因组、蛋白质与功能水平)

每一步都可能成为决定成败的关键点,因此建议科研人员在尝试自主构建之前,对流程有全面理解,或选择可信赖的服务平台加速研究进展。

红棉设计敲除方案 RNP复合物 细胞转染
PCR扩增 单克隆制备 pool效率验证
测序验证 质量检测、细胞冻存

基因敲除细胞工作流程

gRNA设计:编辑成败的起点

gRNA(引导RNA)负责引导Cas9核酸酶定位到目标DNA区域,是实现基因编辑的关键。

gRNA设计要点包括:

· 靶点选择需位于关键外显子区域

· 避免潜在的脱靶区域

· 结合细胞特异性参数优化gRNA表达

推荐工具:

源井生物自主开发的红棉系统-CRISPR基因编辑设计工具”,支持在线自动生成3套敲除策略,并覆盖超过800种细胞系的参数数据。平台还内置超过10,000个实验验证通过的gRNA载体序列,为您的项目提供高可靠性解决方案。点击了解详情>>

转染技术:编辑效率的核心保障

在CRISPR系统导入细胞过程中,转染方法的选择与优化极为关键。每种细胞系(尤其是干细胞、原代细胞和免疫细胞)对转染条件的反应不同 

常见转染方式:

· 电转

· 脂质体转染

· 慢病毒感染(适用于难转染细胞)

源井生物在基因编辑领域深耕多年,已成功优化超过300种细胞系的转染方法,积累了丰富的参数数据库与实操经验,能够显著提高转染效率,缩短实验周期,有效解决不同细胞类型难以转染、编辑效率低的问题。

单克隆挑选与扩增:从群体到纯合KO

高质量的敲除细胞株需来源于单细胞克隆。目前常用的方法包括:

极限稀释法:操作简便、低成本,适合多数贴壁细胞

FACS单细胞分选 (fluorescence-activated cell sorting, FACS):适用于复杂细胞群,可高效分选阳性细胞亚群

在此阶段,细胞生长状态与培养条件非常关键。源井生物在预实验阶段即可评估单克隆形成能力,并采用多策略确保目标克隆顺利扩增。

基因敲除验证:确保实验可信性

验证是构建KO细胞株的最后一环,常用检测方法包括:

基因组水平:qPCR、Sanger测序、NGS

蛋白水平:Western blot(WB)、质谱

功能水平:流式细胞术(FACS)、免疫荧光等

其中,WB验证是评估服务质量与文章发表标准的重要指标。源井生物在WB验证方面具有极高成功率,是高分文章客户的常用选择。点击咨询详情>>

源井生物CRISPR-U™敲除细胞株服务优势

成熟体系支持:CRISPR-U™平台已覆盖5000+现货KO细胞株现货充足,广泛用于科研项目和药物研发。

高效率设计:自动化系统1分钟生成3套KO策略,搭配3大风控工具全面评估项目可行性。

全流程优化:涵盖gRNA设计、转染优化、单克隆筛选至多重验证,确保高成功率。

广泛应用验证:多数细胞株均通过qPCR、Sanger测序、WB等多层级验证,结果可靠、可溯源。

一站式服务: 支持定制化细胞株构建与后续功能分析,助力高水平课题推进与论文发表。

构建基因敲除细胞株是分子生物学研究中的一项核心技术,它的成功实施离不开科学的设计、合理的流程管理与丰富的实验经验。若您正在计划启动KO细胞株构建项目,选择源井生物,让基因编辑更简单、更高效、更可控。

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参考文献

Generating Single Cell–Derived Knockout Clones in Mammalian Cells with CRISPR/Cas9. Curr Protoc Mol Biol. 2019.

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基于CRISPR-U™专利技术,源井生物根据不同细胞特点选择适宜的转染方法(电转法或病毒法),将gRNA和Cas9转入细胞中,然后进行单克隆筛选,通过靶位点扩增及测序验证筛选出成功敲除的阳性克隆,最终交付纯合子细胞株与相关数据报告。
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